凛太郎是一位经营蛋糕店的人，由于身形高大和外表凶恶，小时候周围的人对他都持有偏见。一天，他在店里碰到了唯一的顾客薰子。薰子面前摆着许多空盘子，看到凛太郎就赶紧逃走了，让他误以为又是因为自己的外表吓到了别人，感到沮丧和自责。第二天放学后，他在学校门口看到了薰子在等待……两所相邻但风格迥异的高中——千鸟和桔梗，凛太郎和薰子分别就读于这两所学校，编织出了一段多姿多彩的青春故事。《薰香花朵凛然绽放》讲述了他们之间的交错和成长。