这部影视剧是根据同名漫画改编而成，讲述了高三那年夏天，宝在安慰哭泣的大进时发生的故事。大进深深记得这件事情，于是从福冈一直追到东京的大学找到了宝。一开始大进并不明白自己的感情，但渐渐地对宝产生了爱意。在一次迎新聚餐中，大进喝醉了，宝带他回公寓照顾，趁着醉意向宝表白了。第二天早上，宝吻了吓得面如白纸的大进，表示“接吻感觉还不错，所以我们交往吧”。随后两人长时间相处，宝却突然想要回到自己的住处！？《如宝物般的玻璃珠》述说着一段恋爱中充满曲折与甜蜜的故事。