在东洋第一的娱乐街·歌舞伎町经营着没有标识的百货店的李（森山未来 饰），接二连三遇到了各种各样的事件。这些事件涉及各种各样动机的人，他们都在图谋不轨，所以必须一边揭示背景一边找出原因。因为如果不这样做，矛盾将会无谓地扩大，无法得到解决。解决问题的关键在于从经验和直觉中获取启示。年轻时的李曾经因为误判而失去了同居伴侣的遭遇… 《飞鸟诊所今天也下雨》让观众在这个东洋第一的繁华街区中，领略到了一个不同寻常的故事，穿梭于各种复杂的人际关系中，揭示人性的复杂和扭曲。