在明朝时期，宦官当道，民生艰难。一纸神秘的圣旨，使得东海将领周淮安护送孤女曲灵前往龙门岛上的龙门客栈，准备等待中元节的命令。在客栈里，江湖风云汇聚，暗流涌动。东西两方势力相继登场，掌柜金镶玉施展种种手段，而刺客邱莫言也在其中制造混乱，周淮安渐渐感受到行动背后的种种谜团。中元节临近，龙门岛上的世代血咒和仙药之谜浮出水面，东厂的冯督主因欲得仙药而图谋杀害曲灵。周淮安面临着家族荣耀和内心正义之间的选择，究竟会顺从野心勃勃的冯督主，还是挺身而出抵抗？一场正邪之间的生死决斗即将展开，《新龙门客栈之英雄觉醒》故事由此展开。